Det er ikke udplantningen, der belaster biofilteret – det er fodringen af fiskene. En bølge af udplantning øger behovet for næringsstoffer og dermed fristelsen til at fodre mere, og det er netop denne stigning, der skal spredes ud over tid. Tommelfingerreglen er at øge rationen i små trin og lade en hel uges observation gå imellem hvert trin, frem for at følge frøsåningskalenderen.
Kontrollen foretages på tre indikatorer, ikke én. Ammoniak og nitrit skal forblive ikke-målbare – et spor af nitrit betyder, at bakteriepopulationen endnu ikke absorberer den belastning, du netop har skabt. Opløst ilt skal forblive over 5 mg pr. liter, den grænse der fremgår af vejledningerne om akvaponik i lille skala. pH skal holde sig i det vindue, hvor nitrificerende bakterier og planter trives bedst, omkring 6,8 til 7,2, mens intervallet 6,5 til 7,5 stadig er acceptabelt.
Hvis der viser sig nitrit, er svaret aldrig at tilføje planter eller rense biofilteret. Reducer rationen – nogle gange helt ned til nul i en dag eller to – øg lufttilførslen, og vent til målingen er tilbage på nul, før du fortsætter progressionen.