Proč se škůdci objevují v akvaponickém systému ?
Využívají nerovnováhy, často neviditelné, která vytváří ideální podmínky pro jejich usazení. Akvaponie kombinuje teplo, stálou vlhkost, bujné rostliny a absenci přirozených predatorů. Vlhkost je také jedním z největších lákadel. Místo, kde povrch substrátu zůstává neustále mokrý, se stává dokonalým prostředím pro smutnice a jejich larvy. Naopak část systému vystavená suchému teplu podporuje roztoče. Vnitřní mikroklimatické výkyvy, teplější roh skleníku, méně větraná zóna, stačí ke spuštění koncentrace hmyzu.
Stres rostlin hraje stejně zásadní roli. Nedostatek vápníku, přebytek dusíku, nedostatek světla nebo stagnace vzduchu oslabují rostlinné pletivo. Stresovaná rostlina mění své chemické složení a vytváří signály lákající některý hmyz. Akvaponie ve skleníku nebo uvnitř budovy navíc odstraňuje téměř všechny přirozené predatory (slíunečka, pestřenky, drobné parazitické vosíky). V tomto uzavřeném prostředí stačí sebemenší náhodné zanesení škůdce, na botách, prostřednictvím zakoupené rostliny nebo otevřeným větráním, k vyvolání rychlé invaze.