V akvaponii mohou rostliny vykazovat známky oslabení, i když se systém zdá vyvážený. Bledé listy, zpomalený růst nebo deformace často souvisí s málo viditelnými, ale rozhodujícími mikronedostatky.
Tyto nedostatky se týkají zásadních prvků jako železo, mangan nebo zinek, jejichž příjem silně závisí na pH a chemii vody. Pochopení jejich role a umění je napravit umožňuje trvale zlepšit zdraví rostlin bez narušení akvaponického ekosystému.




