En för liten fiskpopulation leder till otillräcklig näringsproduktion, vilket direkt begränsar systemets bördighet. En obalanserad utfodring av fiskarna är en annan vanlig orsak : om deras mat saknar mångfald eller kvalitet innehåller avfallet inte tillräckligt av vissa element som växterna behöver.
Vattnets pH spelar också en avgörande roll. När det är för högt eller för lågt blir vissa näringsämnen, även om de finns närvarande, omöjliga för rötterna att assimilera. Detta kallas en näringsämneblockning : växterna saknar inte egentligen näringsämnen, men kan inte ta upp dem.
Slutligen kan tekniska problem, såsom dålig vattencirkulation, otillräcklig syresättning eller för svag filtrering, förvärra dessa oförhållanden och bromsa odlingarnas tillväxt.