Det är inte planteringen som belastar biofiltret, utan utfodringen av fiskarna. En omgång omplantning ökar efterfrågan på näringsämnen, och därmed frestelsen att ge mer foder – och det är den ökningen som behöver ske stegvis. Tumregeln är att höja fodergivan i små steg och låta en hel vecka av observation gå mellan varje steg, snarare än att följa såddkalendern.
Kontrollen görs utifrån tre indikatorer, inte bara en. Ammoniak och nitrit ska vara ej detekterbara; ett spår av nitrit innebär att bakteriepopulationen ännu inte absorberar den belastning du just har skapat. Löst syre ska hålla sig över 5 mg per liter, ett gränsvärde som återfinns i faktablad om akvaponik i liten skala. pH ska ligga i det fönster där nitrifierande bakterier och växter samexisterar bäst, ungefär 6,8 till 7,2, med intervallet 6,5 till 7,5 som acceptabelt.
Uppträder nitrit är svaret aldrig att tillsätta växter eller rengöra biofiltret. Minska fodergivan, ibland ända till att pausa ett par dagar, öka luftningen och vänta tills mätvärdet återgår till noll innan du fortsätter upptrappningen.