En av de största fördelarna med utomhusakvaponi är mångfalden av möjliga odlingar. I en sats prioriterar man ofta lättodlade och snabbcyklande växter som sallader, krönsörter eller körsbärstomater. Men det är även möjligt att odla jordgubbar, som särskilt anpassar sig väl till denna typ av system.
I ett akvaponiskt växthus vidgas möjligheterna : man kan odla mer krävande grönsaker som auberginer, meloner, gurkor eller stora tomater.
Vägälskan fiskar beror på klimat och tillgänglig volym. Karpar, öringar, abborrar, göddar eller även målkattfiskar kan födas upp i akvaponi och erbjuder ett brett spektrum av alternativ.