Контроль качества воды крайне важен в аквапонике. Для карпа кои пороги безопасности таковы :
- Аммиак (NH₃) : 0 мг/л. Любой пик — это сигнал тревоги из-за перекорма или нестабильного бактериального цикла.
- Нитриты (NO₂⁻) : 0 мг/л. Токсичны даже в малых дозах, их наличие указывает на недостаточный биофильтр.
- Нитраты (NO₃⁻) : должны оставаться низкими. Высокий уровень говорит о дисбалансе с поглощающей способностью растений.
- pH : 6,5–7,5. Кои боится резких колебаний. Осторожно с дождём, который подкисляет воду прудов.
- Растворённый кислород : мин. 6 мг/л. Непрерывная работа насоса и аэрации (диффузор) необходима.
- Температура : 15–25°C. Вне этого диапазона метаболизм и бактериальная нитрификация нарушаются.