En af de store fordele ved udendørs akvaponik er mangfoldigheden af mulige afgrøder. I et kit vælger man ofte planter, der er nemme at dyrke og har en kort vækstcyklus, som salater, krydderurter eller cherrytomater. Men det er også muligt at dyrke jordbær, som trives særligt godt i denne type system.
I et akvaponisk drivhus udvides mulighederne: her kan man dyrke mere krævende grøntsager som auberginer, meloner, agurker eller store tomater.
Hvad angår fisk, afhænger valget af klimaet og det tilgængelige volumen. Karper, ørred, aborre, sandart eller endda malle kan opdrættes i akvaponik, hvilket giver et bredt udvalg af muligheder.
Et enkelt princip vejleder disse valg: tag udgangspunkt i, hvad Deres vand reelt tillader. I et uopvarmet kit følger temperaturen tæt lufttemperaturen, hvilket naturligt peger mod robuste arter – guldfisk, koikarper, skaller eller suder – samt mod sæsonafgrøder i det kølige forår og efterår. Under drivhus udvides temperaturintervallet, og med det listen over mulige kandidater.
Husk endelig at tage højde for de regulatoriske rammer. Almindelige arter i franske farvande kan holdes uden særlige formaliteter i et privat bassin, mens en eksotisk art som tilapia kun er tilladt i et lukket anlæg uden nogen form for udledning til det naturlige miljø.
Bemærkningen om almindelige arter gælder for Frankrig. Andre steder er listen over fisk, man kan holde uden formaliteter i et privat bassin, ikke den samme, og EU-forordning 1143/2014 forbyder desuden besiddelse af visse arter i hele Unionen. Kontakt den myndighed, der er ansvarlig for fiskeri i Deres land, inden De bestiller fisk: det er gratis og undgår, at købet skal gøres om.