Idealmente, testate ogni settimana e annotate i risultati. Dovreste ottenere sempre al massimo 1 mg/L di NH₃/NH₄⁺, 2 mg/L di NO₂⁻ e un certo livello di NO₃⁻ corrispondente al consumo delle vostre piante. Se l'ammoniaca o i nitriti aumentano, non aspettate : riducete il nourrissage dei pesci (un'eccessiva alimentazione è una causa frequente di picco di ammoniaca), aggiungete temporaneamente un'aerazione supplementare e fate un cambio parziale d'acqua se necessario per diluire le tossine. Pensate inoltre a manutenere il biofiltro senza sterilizzarlo : non sciacquate mai i media filtranti con acqua clorata del rubinetto, ad esempio, pena la morte dei vostri preziosi batteri.
Infine, al lancio di un nuovo sistema o all'introduzione di nuovi pesci, prendete precauzioni per non sovraccaricare il ciclo nascente. Allo stesso modo, si può "pre-ciclare" un sistema aggiungendo una fonte di ammoniaca (attivatore batterico per bacino, per esempio) prima di aggiungere i pesci, il che permette ai batteri benefici di insediarsi senza mettere a rischio la vita degli animali.