Il monitoraggio della qualità dell'acqua è fondamentale in acquaponica. Per la carpa koi, le soglie di sicurezza sono:
- Ammoniaca (NH₃): 0 mg/L. Ogni picco è un campanello d'allarme dovuto a una sovralimentazione o a un ciclo batterico instabile.
- Nitriti (NO₂⁻): 0 mg/L. Tossici anche a basse dosi, la loro presenza indica un biofiltro sottodimensionato.
- Nitrati (NO₃⁻): devono restare bassi. Un valore elevato rivela uno squilibrio rispetto alla capacità di assorbimento delle piante.
- pH: da 6,4 a 7,5. La koi teme le variazioni brusche. Attenzione alla pioggia, che acidifica l'acqua delle vasche.
- Ossigeno disciolto: almeno 5 mg/L. Una pompa e un'aerazione (diffusore) in continuo sono indispensabili.
- Temperatura: da 18 a 24 °C per una crescita ottimale. La koi sopravvive da 0 a 35 °C se i cambiamenti sono graduali, ma al di fuori dell'intervallo ottimale immunità, appetito e nitrificazione batterica diminuiscono.