L’aquaponie permet de cultiver un large éventail de fruits, légumes, herbes et plantes aromatiques, mais il ne faut pas croire qu’elle est universellement adaptée à toutes les espèces végétales. Certaines plantes se révèlent particulièrement mal adaptées à ce type d’environnement en raison de leur besoin en substrat spécifique, de leur sensibilité à l’humidité, ou encore de leur croissance inadaptée aux systèmes aquaponiques.
Les légumes-racines et à bulbes
En tête de liste, on trouve les légumes-racines et à bulbes comme les carottes, pommes de terre, oignons, navets, radis, ou encore betteraves. Dans un lit de culture constamment irrigué, les racines et tubercules risquent de se déformer, de pourrir ou de rester chétifs. En effet, l’humidité constante n’est pas favorable à leur développement, car elle empêche l’aération naturelle du sol.
Les arbres fruitiers
D’autres plantes à croissance lente, ou au système racinaire envahissant, sont également à éviter. Les arbres fruitiers, arbustes ou plantes de grande taille ne sont pas envisageables dans un système domestique en aquaponie, car leur ancrage demande un sol profond et stable, souvent incompatible avec les substrats légers utilisés comme les billes d’argile expansée. Leur longévité et leur taille les rendent difficilement gérables en bac ou tour aquaponique.
Les plantes aux besoins spécifiques en sol
Certaines espèces ont besoin de conditions que l’aquaponie ne peut pas leur offrir. C’est le cas des plantes qui préfèrent des sols secs ou acides, comme certaines plantes de bruyère (ex. : myrtilles, rhododendrons, azalées), ou encore des cactus, qui ne s’épanouiront pas dans un environnement continuellement humide.