Ja, mits u vergelijkt wat vergelijkbaar is. Recirculerende systemen, waarop aquaponie is gebaseerd, werken met een dagelijkse waterverversing van slechts enkele procent van het volume, terwijl een open vijverkwekerij massaal water vernieuwt. Franse pilotprojecten hanteren een orde van grootte van 90% minder water dan een conventionele teelt.
Op schaal van een moestuin thuis speelt de vergelijking ook in het nadeel van vollegrondsteelt. Water wordt niet diep in de bodem afgevoerd en gaat niet verloren door afspoeling; het circuleert in een gesloten lus en verlaat het systeem alleen via verdamping, via transpiratie van de planten en via het kleine beetje dat meegaat met het slib dat uit het filter wordt verwijderd.
In de praktijk is bijvullen regelmatig noodzakelijk, vooral in de zomer en in een kas waar de verdamping oploopt. Kies bij voorkeur voor opgevangen regenwater in plaats van leidingwater, waarvan het chloor sowieso geneutraliseerd moet worden of moet verdampen voordat u het aan de vijver toevoegt.