Aquaponik ermöglicht den Anbau einer Vielzahl von Obst-, Gemüse-, Kräuter- und Aromapflanzen, ist aber nicht für alle Pflanzenarten gleichermaßen geeignet. Manche Pflanzen sind aufgrund ihrer spezifischen Substratansprüche, ihrer Empfindlichkeit gegenüber Feuchtigkeit oder ihrer für Aquaponiksysteme ungeeigneten Wachstumsmuster besonders ungeeignet.
Wurzel- und Knollengemüse
Ganz oben auf der Liste stehen Wurzel- und Knollengemüse wie Karotten, Kartoffeln, Zwiebeln, Steckrüben, Radieschen und Rote Bete. In einem ständig bewässerten Beet besteht die Gefahr, dass Wurzeln und Knollen sich verformen, faulen oder im Wachstum zurückbleiben. Tatsächlich ist ständige Feuchtigkeit ihrer Entwicklung nicht förderlich, da sie die natürliche Belüftung des Bodens verhindert.
Obstbäume
Auch andere langsam wachsende Pflanzen oder solche mit invasiven Wurzelsystemen sollten vermieden werden. Obstbäume , Sträucher oder große Pflanzen eignen sich nicht für ein Aquaponiksystem im Hausgarten, da sie tiefe, stabile Erde benötigen, die oft mit den verwendeten leichten Substraten wie Blähton nicht kompatibel ist. Aufgrund ihrer Langlebigkeit und Größe sind sie in einem Tank oder Aquaponikturm schwer zu handhaben.
Pflanzen mit spezifischen Bodenansprüchen
Manche Pflanzenarten benötigen Bedingungen, die in der Aquaponik nicht gegeben sind. Dies gilt beispielsweise für Pflanzen, die trockene oder saure Böden bevorzugen, wie bestimmte Heidekrautgewächse (z. B. Blaubeeren , Rhododendren , Azaleen ) oder Kakteen , die in einer dauerhaft feuchten Umgebung nicht gedeihen.