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Une filtration complète enchaîne trois étapes. La préfiltration mécanique (mousses, ouate, nouilles en céramique) arrête les particules ; la filtration biologique loge les bactéries qui transforment l'ammonium en nitrate ; le clarificateur UV-C élimine les algues en suspension qui verdissent l'eau. Les billes EHEIM SUBSTRATpro offrent ainsi 450 m² de surface de colonisation par litre, placées après la préfiltration.
Un filtre de bassin se dimensionne sur le volume et sur le peuplement. Le filtre EHEIM PRESS 10000 traite jusqu'à 10 000 L sans poissons, 5 000 L avec des poissons et 2 500 L avec des koïs : la charge des poissons divise la capacité par deux, et par quatre avec des koïs. Pour lancer un filtre neuf, les bactéries de démarrage accélèrent la colonisation ; en bassin, l'IchiPond Optinit se dose à 15 g par mètre cube, dans une eau au-dessus de 10 °C. La collection réunit aussi les stérilisateurs UV-C et les osmoseurs. Pour comprendre le rôle du biofiltre, lisez l'article sur le cycle de l'azote en aquaponie.
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