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Las bacterias nitrificantes transforman el amoníaco que expulsan los peces en nitrito y después en nitrato, la forma que absorben las plantas. Un filtro nuevo carece de ellas: hacen falta varias semanas para que se instalen, es el ciclado. Las bacterias de arranque aceleran esta etapa, las bacterias de mantenimiento reactivan un filtro después de un tratamiento, una limpieza o el invierno, y algunas cepas degradan el lodo del fondo del estanque.
Controle el amonio y el nitrito durante el ciclado con tests de gotas. El artículo El ciclo del nitrógeno en acuaponía explica cada etapa.
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